定义： 正常阴道内虽有多种细菌存在，但由于阴道与这些菌群之间形成生态平衡并不致病。在维持阴道生态平衡中，乳杆菌、雌激素及阴道PH起重要作用。生理情况下，雌激素使阴道上皮增生变厚，并增加细胞内糖原含量，阴道上皮细胞分解糖原为单糖，阴道乳杆菌将单糖转化为乳酸，维持阴道正常点的酸性环境（ph≤4.5，多为3.8~4.4），抑制其他病原体生长，称成为阴道自净作用。正常阴道菌群中，以产生的H2O2及其他抗微生物因子可抑制或杀灭其他细菌。阴道生态平衡一旦被打破或外源性病原体侵入，即可导致炎症发生。
阴道的组织胚胎学分析： 阴道壁由粘膜、肌层和外膜组成。粘膜向阴道腔内形成许多横行皱襞，由上皮和固有层构成。上皮较厚，为非角化型复层扁平上皮。在卵巢分泌的雌激素的作用下，上皮细胞内聚集大量糖原。浅层细胞脱落后，糖原在阴道杆菌作用下转变为乳酸，能防止病菌侵入子宫。阴道上皮的脱落和新生与卵巢活动周期有密切关系，因而根据阴道脱落上皮细胞类型不同可推知卵巢的功能状态。
微生物学分析：
乳杆菌：
菌群失调症：寄生在人体某部位的正常菌群，各菌群之间的比例发生了较大幅度的超出正常范围的改变，多由滥用广谱抗生素引起。由于菌群失调引起的疾病，称为菌群失调症
阴道内正常菌群分布：乳杆菌、类杆菌、表皮葡萄球菌、棒状杆菌、大肠埃希氏菌、链球菌、白假丝酵母菌。
生殖道免疫系统
生殖道黏膜聚集有不同的淋巴细胞组织及淋巴细胞，具有重要的免疫功能，发挥抗感染作用。
阴道自净作用降低引起阴道炎导致不孕：
1、 阴道内环境受卵巢激素的影响，在排卵期呈弱碱性有利于精子的成活。阴道炎症时，阴道内环境不利于精子的成活，影响精子的活动力和穿透力，减少了进入宫颈和子宫内精子数量，从而降低了受孕率。
2、 阴道是重要的生殖免疫器官，其间含有大量的巨噬细胞和浆细胞可识别精子抗原和病原体，并分泌IgA、IgG。阴道炎时精子死亡和精子抗原释放，促进阴道内抗精子抗体生成，直接影响精子成活率、活力、穿透力和降低受孕力。
3、 阴道炎时细菌和病毒内毒素（脂多糖LPS），可诱发巨噬细胞和中性粒细胞生成诱生型一氧化氮合成酶，iNOS,并生成NO。NO作为局部细胞毒因子可杀灭精子和抑制精子的活动力而导致不孕。
4、 外阴阴道感染导致流产几率增加，性传播疾病导致畸形儿增加。
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